Préchauffez votre four à 170°C.
Dans une casserole, versez le lait et le beurre coupé en morceaux avec une pincée de sel et de muscade, puis faites chauffer à feu doux.
Lorsque le beurre est fondu, ajoutez la farine en une seule fois dans la casserole et incorporez-la à l'aide d'une cuillère en bois en mélangeant sans cesse et jusqu'à ce que la pâte soit homogène.
Laissez la pâte sécher sur le feu pendant 1 minute en continuant de remuer.
Battez 2 des œufs + 1 blanc (le jaune servira pour la dorure) en omelette, poivrez et, hors du feu, incorporez progressivement à la pâte tout en remuant bien.
Ajoutez 20 g du comté râpé et mélangez.
Lorsque le tout est bien homogène, versez la pâte dans une poche à douille.
Sur une plaque de four recouverte de papier cuisson, pochez les gougères en les espaçant d'environ 2 centimètres.Dorez-les avec le jaune du dernier œuf, puis parsemez-les avec le Comté râpé. Enfournez pendant 15 à 20 minutes sans ouvrir le four au cours de la cuisson.
Dégustez dès la sortie du four.